Полная последовательность хлоропластного генома Achillea ptarmica, определённая методом секвенирования длинных прочтений

Виды рода Achillea, обычно называемые тысячелистником, относятся к семейству астровых и, как правило, являются многолетними перекрёстноопыляемыми растениями, используемыми в традиционной медицине. В роде происходили события гибридизации и полиплоидизации, что обусловило сложные филогенетические взаимоотношения. Учитывая ограниченное число геномных исследований этого рода, анализ генома диплоидного вида имеет важное значение для понимания его эволюционной биологии и генетического разнообразия. В настоящем исследовании с использованием технологии нанопорового секвенирования длинных прочтений была собрана полная последовательность хлоропластного генома диплоидного вида Achillea ptarmica. Собранный хлоропластный геном длиной 149 252 п.н. с содержанием GC 38% включает большой однокопийный участок длиной 82 498 п.н., малый однокопийный участок длиной 18 458 п.н. и два инвертированных повтора длиной по 24 148 п.н. Геном содержит 89 генов, кодирующих белки, 8 генов рРНК и 37 генов тРНК. Филогенетический анализ объединил A. ptarmica с другими видами Achillea — A. millefolium и A. wilsoniana, поместив их в одну кладу с родом Tanacetum. Точность нанопорового секвенирования была подтверждена сравнением результатов для 10 хлоропластных генов с соответствующими результатами секвенирования по Сэнгеру. Полученные данные представляют ценный генетический ресурс для дальнейших таксономических, эволюционных и филогенетических исследований рода.