Связь генотипа и иммунофенотипа при клональной эволюции ОМЛ с мутацией NPM1: результаты одноклеточного мультиомного анализа

Острый миелоидный лейкоз (ОМЛ) — поликлональное заболевание, представляющее собой совокупность клонов с уникальными, но родственными генотипами; исходные клоны последовательно приобретают новые мутации. Секвенирование образцов, содержащих смесь клеток, не позволяет полностью охарактеризовать клональную структуру ОМЛ и происходящую в ходе терапии клональную эволюцию. Для изучения клональной эволюции мы провели одновременное молекулярное профилирование отдельных клеток и иммунофенотипирование 43 образцов от 32 пациентов с ОМЛ, несущим мутацию NPM1 (нуклеофосмин 1), на разных этапах прогрессирования заболевания. Мы обнаружили, что образцы ОМЛ, взятые при постановке диагноза и при рецидиве, демонстрируют сходные закономерности клональной архитектуры, однако сигнальные мутации повышают клональную сложность, особенно при рецидиве; эта сложность коррелирует с общей выживаемостью. Выявлены специфические связи генотипа с иммунофенотипом, сохраняющиеся независимо от состояния заболевания, что позволяет предположить: траектории дифференцировки лейкозных клеток могут быть предопределены имеющимися мутациями. Анализ образцов, полученных в динамике у пациентов, получавших первичную терапию ОМЛ, выявил изменения клонального состава и иммунофенотипа, соответствующие установленным связям генотипа с иммунофенотипом.