Геномные изменения при опухолях у детей: клиническая значимость и трансляционные выводы

Введение: Рак является ведущей причиной смертности детей от заболеваний. Секвенирование нового поколения (NGS) стало важным инструментом прецизионной онкологии, позволяющим выявлять соматические геномные изменения, которые могут иметь значение для диагностики, оценки прогноза и выбора лечения. В настоящем исследовании оценивалась клиническая полезность NGS у израильских детей с онкологическими заболеваниями.

Методы: Проведён ретроспективный анализ данных детей с онкологическими заболеваниями, которым в медицинском центре «Шиба» выполняли NGS в период с 2016 по 2021 год. Для выявления и аннотации геномных вариантов применяли биоинформатические алгоритмы. Медицинскую документацию анализировали, чтобы сопоставить молекулярные находки с изменениями лечения и клиническими исходами.

Результаты: Проанализированы данные 97 пациентов; выявлен гетерогенный спектр соматических изменений. Повторяющиеся варианты обнаружены в генах, участвующих в репарации ДНК, регуляции клеточного цикла и сигнальных путях. Несколько вариантов, первоначально классифицированных как варианты неопределённой клинической значимости, впоследствии были реклассифицированы как патогенные с учётом обновлённых геномных данных. Сравнительный анализ выявил уникальные молекулярные особенности детских онкологических заболеваний в израильской популяции по сравнению с международными когортами.

Выводы: Комплексное геномное профилирование даёт клинически значимую информацию в детской онкологии. NGS способствует выявлению вариантов, имеющих значение для выбора лечения, поддерживает персонализацию терапии и подчёркивает важность дальнейших геномных исследований и международного сотрудничества для улучшения исходов у детей с онкологическими заболеваниями.

Значимость: NGS позволяет выявлять мутации, имеющие значение для выбора лечения, при детских онкологических заболеваниях; закономерности мутаций охарактеризованы в крупных международных когортах. Настоящее исследование дополняет представления о ландшафте мутаций у детей с онкологическими заболеваниями. Почти 25% пациентов получили пользу от терапии, выбранной на основании результатов NGS, что поддерживает проведение рутинного геномного профилирования при постановке диагноза.