Популяционная структура и анализ собственных значений
Population structure and eigenanalysis
Аннотация
Современные методы выявления популяционной структуры по генетическим данным не позволяют проводить формальные тесты статистической значимости дифференциации популяций. Мы рассматриваем подход к изучению популяционной структуры — анализ главных компонент, впервые применённый к генетическим данным Кавалли-Сфорцей и его коллегами. Мы придаём этому методу строгое статистическое обоснование, используя результаты современной статистики для разработки формальных тестов значимости. Кроме того, мы выявляем общее явление «фазового перехода», связанное с возможностью обнаружения структуры в генетических данных. Оно следует из используемой статистической теории и имеет важное значение для выявления структуры: при фиксированном, но большом объёме данных расхождение между двумя популяциями, измеренное, например, с помощью статистики типа FST, ниже определённого порога практически не выявляется, тогда как при небольшом превышении этого порога обнаружение становится лёгким. Это позволяет предсказать объём данных, необходимый для выявления структуры.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.