Представление mothur: открытое, платформонезависимое программное обеспечение с поддержкой сообщества для описания и сравнения микробных сообществ

Цель mothur — стать комплексным программным пакетом, позволяющим анализировать данные секвенирования сообществ с помощью единого программного средства. Пакет основан на ранее разработанных инструментах и обеспечивает гибкий и мощный анализ данных секвенирования. В качестве примера мы использовали mothur для обрезки, фильтрации и выравнивания последовательностей; расчёта расстояний; отнесения последовательностей к операционным таксономическим единицам; а также описания альфа- и бета-разнообразия восьми морских образцов, ранее исследованных методом пиросеквенирования фрагментов гена 16S рРНК. Анализ более 222 000 последовательностей с помощью ноутбука был выполнен менее чем за 2 ч.