Метод объединения соседей: новый способ реконструкции филогенетических деревьев

Предлагается новый метод реконструкции филогенетических деревьев по данным об эволюционных расстояниях — метод объединения соседей. На каждом этапе кластеризации, начиная со звездообразного дерева, он позволяет находить пары операционных таксономических единиц (ОТЕ, или соседей), при объединении которых суммарная длина ветвей минимальна. Метод позволяет быстро получить как длины ветвей, так и топологию парсимоничного дерева. С помощью компьютерного моделирования мы сравнили эффективность этого метода при восстановлении правильного неукоренённого дерева с эффективностью пяти других методов построения деревьев: метода невзвешенного попарного группового анализа, метода Фарриса, метода Саттата и Тверски, метода Ли и модифицированного метода Фарриса, предложенного Татэно и соавт. Показано, что новый метод объединения соседей и метод Саттата и Тверски в целом превосходят остальные методы.