Разработка и валидация Segment — свободно распространяемого программного обеспечения для анализа изображений сердечно-сосудистой системы

Введение: Коммерчески доступное программное обеспечение для анализа изображений сердечно-сосудистой системы часто обладает ограниченной функциональностью и нередко не проходит тщательной валидации, необходимой для клинических исследований. Ранее нами уже была реализована программа для анализа изображений сердечно-сосудистой системы и выпущена как свободно распространяемое программное обеспечение для исследовательского сообщества. Однако она распространялась как автономное приложение, и другие исследователи не могли расширять ее, создавая собственные специализированные алгоритмы анализа изображений. Мы считаем, что объем работы, необходимый для создания клинически применимого прототипа, можно уменьшить за счет расширяемости программного обеспечения, чтобы исследователи могли разрабатывать собственные модули или улучшения. Такая инициатива может служить связующим звеном между исследованиями в области анализа изображений и кардиоваскулярными исследованиями. Цель данной статьи — представить разработку и валидацию программного пакета для анализа изображений сердечно-сосудистой системы (Segment) и объявить о его выпуске в формате исходного кода.

Результаты: Segment можно использовать для анализа изображений при магнитно-резонансной томографии, компьютерной томографии, однофотонной эмиссионной компьютерной томографии и позитронно-эмиссионной томографии. Среди его основных возможностей — загрузка DICOM-изображений от всех крупных производителей томографов, одновременное отображение нескольких наборов изображений и пересечений плоскостей, автоматическая сегментация левого желудочка, количественная оценка кровотока по данным магнитно-резонансной томографии, инструменты для ручной и общей сегментации объектов, количественный анализ регионарной сократимости стенок, оценка жизнеспособности миокарда и инструменты для совмещения изображений. Здесь мы представляем обзор результатов валидации и процедур валидации функциональности программного обеспечения. Мы описываем метод, позволяющий сохранять точность и валидность программы, путем внедрения и использования тестового сценария, который проверяет ее функциональность и валидирует выходные данные. Программное обеспечение было бесплатно размещено для исследовательских целей в формате исходного кода на сайте проекта http://segment.heiberg.se.

Выводы: Segment — хорошо валидированный комплексный программный пакет для анализа изображений сердечно-сосудистой системы. Он бесплатно доступен для исследовательских целей при условии ссылки на соответствующие оригинальные публикации, связанные с этим программным обеспечением.