Виртуальный скрининг с использованием AutoDock: теория и практика

Значимость для области: Виртуальный скрининг — компьютерный метод выявления перспективных соединений, способных связываться с молекулой-мишенью с известной структурой. В связи с быстрым ростом числа структур белков и нуклеиновых кислот виртуальный скрининг продолжает развиваться как эффективный метод поиска новых ингибиторов и лекарственных молекул. Рассматриваемые вопросы: Описаны методы виртуального скрининга, доступные в составе программ AutoDock, а также несколько успешных примеров применения виртуального скрининга с использованием AutoDock для поиска перспективных соединений при разработке лекарственных препаратов. Что получит читатель: Представлен общий обзор проблем виртуального скрининга и инструментов программного комплекса AutoDock, предназначенных для их решения. Основной вывод: Виртуальный скрининг — эффективный инструмент поиска соединений, которые могут использоваться в качестве перспективных соединений при разработке лекарственных препаратов, а бесплатная программа AutoDock с открытым исходным кодом является эффективным средством виртуального скрининга.