Анализ микробных сообществ с ультравысокой пропускной способностью на платформах Illumina HiSeq и MiSeq
Ultra-high-throughput microbial community analysis on the Illumina HiSeq and MiSeq platforms
Аннотация
Стоимость секвенирования ДНК продолжает снижаться: Illumina HiSeq2000 за десятидневный запуск генерирует до 600 ГБ парных чтений длиной 100 оснований. Здесь мы представляем протокол ампликонного секвенирования микробных сообществ на платформах Illumina HiSeq2000 и MiSeq и применяем его для секвенирования 24 микробных сообществ из сред, связанных с хозяином, и из свободноживущих экосистем. По мере появления все большего числа платформ секвенирования критически важным становится вопрос, согласуются ли биологические выводы, полученные на одной платформе, с выводами, которые были бы сделаны на другой. Мы показываем, что разработанный для этих приборов протокол успешно воспроизводит известные биологические результаты, а также что биологические выводы согласуются между платформами секвенирования (HiSeq2000 и MiSeq) и между секвенированными участками ампликонов.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.