Использование технологий секвенирования нового поколения для полногеномного выявления транспозиций
Use of Next Generation Sequencing (NGS) technologies for the genome-wide detection of transposition
Аннотация
Растительные транспозируемые элементы повсеместно распространены у эукариот. Их способность в большом количестве присутствовать в геномах многих видов растений и животных привлекла внимание специалистов по структурной и функциональной геномике. Хотя в последнее время разработан ряд биоинформатических программ для аннотирования транспозируемых элементов в секвенированных геномах, существует очень мало вычислительных инструментов, специально предназначенных для выявления активных транспозируемых элементов на уровне всего генома. В этой статье мы описываем SearchTESV — разработанный нами конвейер для выявления структурных вариантов, связанных с транспозируемыми элементами, с использованием технологий секвенирования нового поколения (NGS).
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.