Характеристика профилей кишечной микробиоты у пациентов с ишемической болезнью сердца методом интеллектуального анализа данных полиморфизма длины терминальных рестрикционных фрагментов: кишечная микробиота может служить диагностическим маркером ишемической болезни сердца

Связь атеросклероза с кишечной микробиотой привлекает всё больше внимания. Ранее мы продемонстрировали возможную связь между кишечной микробиотой и ишемической болезнью сердца (ИБС). Целью настоящего исследования была характеристика профилей кишечной микробиоты у пациентов с ИБС с помощью интеллектуального анализа данных полиморфизма длины терминальных рестрикционных фрагментов (T-RFLP). В исследование включили 39 пациентов с ИБС и 30 контрольных участников без ИБС, сопоставленных по возрасту и полу и имевших факторы риска ИБС. Бактериальную ДНК выделяли из образцов кала и анализировали методом T-RFLP и с помощью интеллектуального анализа данных с применением алгоритма классификации и регрессии. Для проверки надёжности анализа дополнительно набрали пять пациентов с ИБС. Интеллектуальный анализ данных позволил разделить состав кишечной микробиоты на два характерных узла. В группе ИБС 35 из 39 пациентов (90%) были отнесены к четырём узлам, характерным для ИБС, а в контрольной группе 28 из 30 участников (93%) — к трём узлам, характерным для контроля. Пять дополнительных образцов пациентов с ИБС обработали с помощью той же модели разделения, что позволило проверить точность прогнозирования риска ИБС методом интеллектуального анализа данных. Операционные таксономические единицы 853 (OTU853), 657 (OTU657) и 990 (OTU990) оказались значимыми как по результатам интеллектуального анализа данных, так и при стандартном статистическом сравнении. С помощью интеллектуального анализа данных T-RFLP были охарактеризованы профили кишечной микробиоты у пациентов с ИБС; результаты указывают на возможность использования кишечной микробиоты в качестве диагностического маркера ИБС.