Экологически обоснованные преобразования для ординации видовых данных

В статье рассматриваются способы построения биплотов видов при ординации без ограничений и с ограничениями без использования евклидова расстояния, применяемого в анализе главных компонент (PCA) и анализе избыточности (RDA), или расстояния хи-квадрат, сохраняемого в анализе соответствий (CA) и каноническом анализе соответствий (CCA). Эти расстояния не всегда подходят для анализа данных о составе сообществ. Для решения этой проблемы предлагаются преобразования таблиц видовых данных. Они позволяют экологам применять основанные на евклидовом расстоянии методы ординации, такие как PCA и RDA, к данным о сообществах, устраняя проблемы, связанные с евклидовым расстоянием, и избегая CA и CCA, которые в некоторых случаях также имеют недостатки. Это позволяет использовать исходные (преобразованные) видовые данные в RDA для проверки связей с объясняющими переменными — переменными среды или факторами многофакторной модели дисперсионного анализа; при этом можно строить биплоты, отображающие взаимосвязи видов с объясняющими переменными. Другой вариант применения — использование видовых данных в других методах многомерного анализа, оптимизирующих функцию потерь методом наименьших квадратов; примером служит разбиение методом K-means.