Молекулярно-динамическое моделирование и разработка новых лекарственных препаратов

Молекулярно-динамическое моделирование (МДМ) позволяет получать не только обширную информацию о динамической структуре биомакромолекул, но и разнообразные энергетические данные о взаимодействии белков с лигандами. Эти сведения имеют большое значение для понимания взаимосвязи структуры и функции мишени, сущности белково-лигандных взаимодействий, а также для совершенствования процесса поиска и разработки лекарственных препаратов. Поэтому МДМ широко и успешно применяют на всех этапах современной разработки лекарственных средств. Область обзора: Рассмотрено применение МДМ при разработке новых лекарственных препаратов, включая изучение механизмов патогенеза амилоидозов, виртуальный скрининг и механизмы взаимодействия лекарственных препаратов с мишенями. Мнение эксперта: МДМ широко используют для изучения механизмов развития заболеваний, обусловленных неправильным сворачиванием белков, виртуального скрининга и механизмов лекарственной устойчивости, возникающей вследствие мутаций мишени. Решить эти задачи только экспериментальными методами крайне трудно. Поэтому в будущем область применения МДМ будет расширяться по мере роста вычислительных возможностей, разработки более эффективных методов выборки конфигураций и более точных силовых полей, а также совершенствования методов анализа.