Изменения микробиома, вызванные респираторными вирусными инфекциями, и вторичная бактериальная пневмония

Грипп и другие респираторные вирусные инфекции относятся к наиболее распространённым острым респираторным инфекциям. Вирусные инфекции предрасполагают к вторичным бактериальным инфекциям, которые часто протекают тяжелее. Механизмы развития поствирусных бактериальных инфекций сложны и включают многофакторные процессы, опосредованные взаимодействием вирусов, бактерий и иммунной системы организма. Исследования, проведённые за последние 15 лет, показали, что на слизистых оболочках желудочно-кишечного и дыхательного трактов обитают уникальные микробные сообщества, оказывающие прямое и опосредованное влияние на защиту организма от вирусных инфекций. Кроме того, противовирусные иммунные реакции, возникающие при острых респираторных инфекциях, таких как грипп, сопровождаются изменениями состава и функций микробиоты дыхательных путей и желудочно-кишечного тракта («дисбиозом»). Эти изменения, в свою очередь, могут нарушать последующий иммунный ответ на вторичную бактериальную инфекцию или менять динамику межмикробных взаимодействий, способствуя размножению потенциально патогенных видов бактерий. В этом обзоре обобщены данные о взаимодействии микробных сообществ организма с его защитными механизмами, а также о том, как грипп и другие острые респираторные вирусные инфекции нарушают эти взаимодействия и тем самым способствуют патогенезу вторичных бактериальных инфекций.