Выявление Mycobacterium tuberculosis в образцах кала детей с помощью технологии TruTip

Введение: Быстрая и точная диагностика туберкулеза у детей затруднена, поскольку дети часто не могут сдать мокроту, необходимую для стандартных исследований. Альтернативным материалом служит кал, который легко собрать у ребенка. Исследования молекулярного выявления Mycobacterium tuberculosis (Mtb) в кале дали обнадеживающие результаты. Целью нашей работы была оценка кала как альтернативного мокроте материала для выявления Mtb у детей. Для этого использовали новую автоматизированную платформу TruTip (Akonni Biosystems) для лизиса и выделения нуклеиновых кислот.

Методы: Исследовали образцы кала 259 детей в возрасте от 0 до 14 лет с симптомами туберкулеза, обратившихся за медицинской помощью в Лиме, Перу. После выделения материала с помощью TruTip наличие ДНК Mtb определяли методом ПЦР в реальном времени с мишенью IS6110. Чувствительность теста оценивали в двух группах: (1) дети с культурально подтвержденным туберкулезом (N = 22) и (2) дети с клинически диагностированным, но лабораторно не подтвержденным туберкулезом (N = 84). Специфичность рассчитывали у детей, у которых туберкулез был исключен (N = 153). Среди детей с диагнозом туберкулеза изучили факторы, связанные с положительным результатом исследования кала.

Результаты: Чувствительность теста составила 59% (95% доверительный интервал [ДИ]: 39–80%) у детей с культурально подтвержденным туберкулезом и 1,2% (95% ДИ: 0,0–6,5%) у детей с клинически диагностированным, но лабораторно не подтвержденным туберкулезом; специфичность составила 97% (95% ДИ: 93–99%). Тест выявил Mtb в кале у 7 из 7 детей с положительным результатом микроскопии мазка (чувствительность 100%; 95% ДИ: 59–100%) и у 6 из 15 детей с отрицательным результатом микроскопии мазка, но культурально подтвержденным туберкулезом (чувствительность 40%; 95% ДИ: 16–68%). С положительным результатом исследования кала были связаны более старший возраст, положительные результаты микроскопии мазка и посева, способность сдать мокроту и наличие каверн.

Выводы: Исследование образцов кала с помощью рабочей станции TruTip и амплификации IS6110 обеспечило показатели чувствительности и специфичности, сопоставимые с результатами других тестов, например Xpert. В дальнейших исследованиях следует оценить возможность выявления лекарственной устойчивости с помощью закрытой системы амплификации TruTip и оптимизировать тест для повышения чувствительности у детей с низкой бактериальной нагрузкой.