Компьютерный скрининг китайских лекарственных растений с потенциальной прямой ингибирующей активностью в отношении нового коронавируса 2019 года

Цель: Провести рациональный скрининг китайских лекарственных растений, широко применяемых при вирусных инфекциях дыхательных путей и содержащих соединения, способные непосредственно ингибировать новый коронавирус 2019 года (2019-nCoV), вызывающий пневмонию.

Методы: Скрининг состоял из двух основных этапов. На первом этапе выполнили поиск публикаций о природных соединениях, биологически подтверждённо активных в отношении коронавируса тяжёлого острого респираторного синдрома или коронавируса ближневосточного респираторного синдрома. Затем проверили наличие этих соединений в базе данных фармакологии систем традиционной китайской медицины. Соединения, соответствовавшие обоим критериям, подвергли оценке всасывания, распределения, метаболизма и выведения (ADME), чтобы определить потенциальную эффективность при приёме внутрь. Далее с помощью молекулярного докинга оценили возможность прямого взаимодействия соединений с белками 2019-nCoV. На втором этапе провели поиск в базах данных китайских лекарственных растений, чтобы выявить растения, содержащие отобранные соединения. Растения, содержащие два или более соединений, выявленных при скрининге, проверили по каталогам традиционного применения. Наконец, с помощью сетевого фармакологического анализа спрогнозировали общие эффекты каждого отобранного растения в организме.

Результаты: Среди изученных природных соединений 13 соединений, входящих в состав средств традиционной китайской медицины, также продемонстрировали потенциальную активность в отношении 2019-nCoV. Кроме того, 125 китайских лекарственных растений содержали два или более из этих 13 соединений. Из них 26 растений традиционно применялись для лечения вирусных инфекций дыхательных путей. Согласно результатам сетевого фармакологического анализа, предполагаемые эффекты этих 26 растений в организме связаны с регуляцией вирусной инфекции, иммунных и воспалительных реакций, а также ответа на гипоксию.

Выводы: Китайские растительные средства, традиционно применяемые при вирусных инфекциях дыхательных путей, могут содержать соединения с прямой активностью в отношении 2019-nCoV.