Структурные основы 3CLpro SARS-CoV-2 и поиск средств против COVID-19 среди лекарственных растений

Недавняя пандемия коронавирусной инфекции 2019 года (COVID-19), вызванная SARS-CoV-2, стала причиной глобальной обеспокоенности в сфере здравоохранения. Вирусная 3-химотрипсиноподобная цистеиновая протеаза (3CLpro) контролирует репликацию коронавируса и необходима для его жизненного цикла. 3CLpro уже зарекомендовала себя как перспективная мишень для разработки лекарственных препаратов против коронавируса тяжёлого острого респираторного синдрома (SARS-CoV) и коронавируса ближневосточного респираторного синдрома (MERS-CoV). Недавние исследования показали, что геномная последовательность SARS-CoV-2 очень сходна с последовательностью SARS-CoV. Поэтому мы проанализировали последовательность 3CLpro, построили её трёхмерную гомологичную модель и провели скрининг библиотеки лекарственных растений, содержащей 32 297 потенциальных противовирусных фитохимических соединений и соединений, используемых в традиционной китайской медицине. По результатам анализа девять лучших соединений могут служить потенциальными соединениями-лидами против SARS-CoV-2 для дальнейшей оптимизации и разработки лекарственных препаратов для борьбы с COVID-19.