Генотип и фенотип COVID-19: их роль в патогенезе

COVID-19 — новый коронавирус, вызвавший вспышку необычной вирусной пневмонии в Ухане, Китай, а затем пандемию. По филогенетическим связям и структуре генома COVID-19 относится к роду Betacoronavirus. Бетакоронавирусы человека (SARS-CoV-2, SARS-CoV и MERS-CoV) имеют много сходств, но также различаются по геномной и фенотипической структуре, что может влиять на их патогенез. COVID-19 содержит одноцепочечную РНК положительной полярности, связанную с нуклеопротеином внутри капсида, образованного матриксным белком. Типичный коронавирус содержит в геноме не менее шести ORF. Все структурные и вспомогательные белки транслируются из субгеномных РНК коронавирусов. Четыре основных структурных белка кодируются ORF 10 и 11 на одной трети генома вблизи 3'-конца. Генетическая и фенотипическая структура COVID-19 важна для его патогенеза. В статье выделены наиболее важные из этих особенностей в сравнении с другими бетакоронавирусами.