Пересечение царств: как микобиота и взаимодействия грибов с бактериями влияют на здоровье и болезни хозяина

Термин «микробиота» обычно вызывает представление о слизистых оболочках, густо заселенных бактериями. Действительно, эти поверхности и образуемые ими полостные пространства преимущественно содержат бактерии. Однако исследования последнего десятилетия начали дополнять эту картину, сосредоточившись на важных, но в значительной степени недооцененных компонентах микробиоты: грибах, вирусах и археях. Сообщество комменсальных грибов, также называемое микобиотой, взаимодействует с комменсальными бактериями и хозяином. Поэтому неудивительно, что изменения микобиоты существенно влияют на здоровье хозяина и связаны с патологическими состояниями, такими как воспалительное заболевание кишечника (ВЗК). В этом обзоре представлен обзор того, почему микобиота является важной областью исследований, а также различных инструментов для ее изучения. Особое внимание уделено различению транзиторных и активно колонизирующих грибов в составе микобиоты полости рта и кишечника и их роли в здоровье и болезни. Помимо корреляционных и наблюдательных исследований, обсуждаются механистические работы, посвященные специфическим межцарственным взаимодействиям грибов, бактерий и хозяина.