Выявление селективного ингибитора циклинзависимой киназы 2 из библиотеки соединений на основе пирролон-конденсированного бензосуберена: компьютерное исследование

Повышенная экспрессия циклинзависимой киназы 2 связана с развитием многих видов рака, поэтому на протяжении почти двух десятилетий эта киназа активно изучается. Основная цель настоящего исследования заключалась в разработке новых высокоактивных и специфичных ингибиторов CDK2 для подавления пролиферации опухолевых клеток. В качестве эталонных ингибиторов для сравнения с синтезированными в нашей лаборатории соединениями на основе пирролон-конденсированного бензосуберена были выбраны Flavopiridol, SU9516 и CVT-313. На основании эффективности лиганда и аффинности связывания мы оценили Ligand2 как селективный ингибитор CDK2, не взаимодействующий с внецелевыми мишенями CDK1 и CDK9. Анализ результатов динамического моделирования и расчётов свободной энергии связывания показал, что Ligand2 образует стабильное взаимодействие, а его свободная энергия сопоставима с таковой у эталонных ингибиторов. Эти результаты позволяют рассматривать потенциально природную молекулу Ligand2 в качестве селективного ингибитора CDK2 с низким риском побочных эффектов.