Атлас генетических ассоциаций для 220 фенотипов человека в разных популяциях

Современные полногеномные исследования ассоциаций пока не охватывают достаточное разнообразие популяций и спектр фенотипов. Чтобы расширить атлас генетических ассоциаций для непредставленных в Европе популяций, мы провели 220 полногеномных исследований глубокого фенотипирования (заболевания, биомаркеры и применение лекарств) в BioBank Japan (n = 179 000), используя анамнез и текстовый анализ электронных медицинских записей. Метанализы с UK Biobank и FinnGen (n = 628 000) выявили около 5000 новых локусов, что повысило разрешение геномной карты признаков человека. Этот атлас прояснил картину плейотропии, представленную локусом главного комплекса гистосовместимости, где мы провели тонкое картирование HLA. Наконец, мы выполнили статистическое разложение матриц общегеномных сводных данных фенома и выявили латентные генетические компоненты, которые указывают на ответственные варианты и биологические механизмы, лежащие в основе существующих классификаций заболеваний в разных популяциях. Разложенные компоненты позволили генетически обоснованно выделять подтипы сходных заболеваний, например аллергических. Наше исследование указывает на возможный путь повторного изучения заболеваний человека с помощью генетики без предварительных гипотез.