Изучение возможности ингибирования РНК-зависимой РНК-полимеразы вируса Хантаан методами компьютерного моделирования

Вирус Хантаан относится к семейству Hantaviridae и представляет собой сегментированный вирус с отрицательной цепью РНК (sNSV). Он вызывает геморрагическую лихорадку с почечным синдромом, для которой характерны лихорадка, сосудистые кровоизлияния и почечная недостаточность. Это одно из наиболее тяжёлых геморрагических заболеваний в мире; высокая летальность делает его серьёзной проблемой общественного здравоохранения. Комплекс РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp) вируса Хантаан участвует в транскрипции и репликации вирусной РНК, необходимых для сохранения и распространения вируса, поэтому служит важной мишенью для разработки противовирусных препаратов. Перспективным направлением поиска таких препаратов может быть нарушение реакции «захвата кэп-структуры», осуществляемой эндонуклеазным доменом RdRp вируса Хантаан. Каталитическая активность этого домена зависит от ионов металлов. Для выявления веществ, способных связываться с эндонуклеазой и нарушать её активность, провели молекулярный докинг, моделирование молекулярной динамики, прогнозирование всасывания, распределения, метаболизма, выведения и токсичности, а также оценку соответствия свойствам лекарственных препаратов. По результатам докинга перамивир и ингавирин эффективно связывались с ионами марганца и взаимодействовали с другими остатками активного центра белка. Молекулярное моделирование также показало стабильное связывание этих лигандов с активным центром RdRp вируса Хантаан. Анализ моделирования выявил постоянные контакты лигандов с ионами марганца и аминокислотными остатками эндонуклеазного домена вируса. Результаты исследования помогут лучше понять вирус Хантаан и родственные ему вирусы.