Биология вариантов SARS-CoV-2: иммунное уклонение, передача и приспособленность

В конце 2020 года, почти через год после начала циркуляции в человеческой популяции, коронавирус 2, вызывающий тяжёлый острый респираторный синдром (SARS-CoV-2), совершил значительный скачок в адаптации к человеку. Эти формы SARS-CoV-2 с большим числом мутаций передавались эффективнее, чем предыдущие варианты, и получили название «варианты, вызывающие обеспокоенность» (VOC). Варианты Альфа, Бета, Гамма, Дельта и Омикрон возникли независимо друг от друга; каждый из них быстро становился доминирующим на региональном или глобальном уровне, вытесняя ранее преобладавшие варианты. Успех каждого VOC по сравнению с предшествующим доминирующим вариантом обеспечивался изменениями собственных функциональных свойств вируса и в различной степени — изменением его антигенности, благодаря чему вирус мог уклоняться от сформированного иммунного ответа. Повышенная приспособленность вируса, связанная с VOC, обусловлена сложным взаимодействием особенностей биологии вируса с меняющимся уровнем иммунитета населения, сформированного вакцинацией и предшествующей инфекцией. В этом обзоре обобщены данные о сравнительной заразности и антигенности вариантов SARS-CoV-2, роли мутаций в участке расщепления S-белка фурином и белков, не относящихся к S-белку, возможном значении рекомбинации для успеха вируса, а также об эволюции SARS-CoV-2 в контексте Т-клеточного, врождённого и популяционного иммунитета. Между антигенностью, передачей и вирулентностью SARS-CoV-2 существует сложная взаимосвязь, последствия которой для дальнейшей эволюции вируса и бремени COVID-19 непредсказуемы.