Белок энтерококкового бактериофага подавляет ферменты рестрикции IV типа, участвующие в противофаговой защите

Распространённость инфекций, вызванных бактериями с множественной лекарственной устойчивостью, продолжает расти, тогда как разработка необходимых для борьбы с ними антибиотиков практически не продвигается. Энтерококки с множественной лекарственной устойчивостью вносят значительный вклад в эту проблему. Один из возможных подходов к лечению таких инфекций — фаготерапия, при которой литические вирусы заражают и уничтожают патогенные бактерии. Хотя обнаружены фаги, способные лизировать некоторые штаммы энтерококков с множественной лекарственной устойчивостью, другие штаммы обладают высокой устойчивостью, а лежащие в её основе механизмы изучены недостаточно. С помощью скрининга методом CRISPRi мы выявили генетический локус на мобилизуемой плазмиде Enterococcus faecalis, связанный с устойчивостью к фагам. В состав этого локуса входят ген предполагаемой сериновой рекомбиназы и расположенный за ним ген фермента рестрикции IV типа. Мы показали, что этот фермент ограничивает репликацию фага phi47 у E. faecalis, устойчивого к ванкомицину. Кроме того, фаг phi47 способен преодолеть это ограничение, приобретая миссенс-мутацию, затрагивающую белок-ингибитор фермента рестрикции IV типа. Мы показали, что этот ингибитор, названный фактором ингибирования рестрикции IV типа A (TifA), связывает и инактивирует различные ферменты рестрикции IV типа. Полученные данные расширяют представления о противофаговой защите E. faecalis с лекарственной устойчивостью и раскрывают механизм, с помощью которого фаги преодолевают системы противофаговой защиты.