База данных структур белков AlphaFold и 3D-Beacons: новые данные и возможности

База данных структур белков AlphaFold (https://alphafold.ebi.ac.uk/) стала значительно функциональнее и доступнее для исследователей в области наук о жизни. Благодаря интеграции прогнозов AlphaMissense теперь можно оценивать патогенность миссенс-вариантов белков человека. Интерактивная тепловая карта и трёхмерная визуализация отображают данные о вариантах на уровне аминокислотных остатков. Пользователи могут переключаться между показателями качества модели структуры (pLDDT) и средними оценками патогенности, чтобы оценить возможные последствия изменений конкретных остатков. Интеграция Foldseek обеспечивает быстрый и точный поиск белковых структур и их сравнение. Возможность массовой загрузки данных упрощает комплексный анализ и интеграцию с другими вычислительными инструментами. Инфраструктура 3D-Beacons (https://www.ebi.ac.uk/pdbe/pdbe-kb/3dbeacons/) также усовершенствована: добавлены подробные конечные точки для аннотированных данных, в том числе AlphaMissense, и интегрирован набор данных LevyLab с гомомерными моделями AlphaFold 2. Эти усовершенствования расширяют функциональность и доступность ресурсов, открывая новые возможности для исследований с использованием структурных данных.