Соединения манжетки обыкновенной как ингибиторы онкобелка E6 ВПЧ-16: перспективный потенциал кверцетина по данным компьютерного моделирования

Введение: Онкогенный потенциал ВПЧ остаётся серьёзной глобальной проблемой общественного здравоохранения, поэтому для профилактики рака изучаются различные природные терапевтические средства. Природные соединения манжетки обыкновенной обладают противовоспалительными, антиоксидантными, противовирусными и противоопухолевыми свойствами.

Цель: Изучить с помощью биоинформатических методов потенциальное ингибирующее действие соединений манжетки обыкновенной на белок-мишень ВПЧ.

Методы: Структуры кверцетина, катехина, апигенина, лютеолина, кофейной и галловой кислот были получены из базы данных PubChem, а структура онкобелка E6 ВПЧ-16 (идентификатор PDB: 4XR8) — из Protein Data Bank. В AutoDock Vina провели виртуальный скрининг и молекулярный докинг. Белково-лигандные комплексы визуализировали с помощью Discovery Studio. Моделирование молекулярной динамики комплекса 4XR8 с кверцетином выполнили в Desmond.

Результаты: По данным молекулярного докинга, кверцетин продемонстрировал наиболее высокое сродство к 4XR8 (кверцетин — −8,9 ккал/моль; апигенин — −8,7 ккал/моль; лютеолин — −8,7 ккал/моль; катехин — −8,4 ккал/моль; кофейная кислота — −7,3 ккал/моль; галловая кислота — −6,8 ккал/моль). Результаты моделирования молекулярной динамики подтверждают стабильность комплекса и высокое сродство кверцетина к онкобелку E6 ВПЧ-16.

Выводы: Природные соединения манжетки обыкновенной, особенно кверцетин, обладают перспективным потенциалом для лечения ВПЧ-инфекции; для дальнейшего изучения необходимы дополнительные исследования in vitro и in vivo.