Тенденции устойчивости к противомикробным препаратам и распределение генетических линий среди изолятов при инвазивной пневмококковой инфекции до и после внедрения пневмококковой конъюгированной вакцины в Южной Африке

Цель: Пневмококковые конъюгированные вакцины (PCV) во всём мире снизили заболеваемость инвазивной пневмококковой инфекцией (ИПИ), вызванной устойчивыми к противомикробным препаратам возбудителями. Мы оценили динамику ИПИ с устойчивостью к противомикробным препаратам и распределение генетических линий пневмококка до и после внедрения в Южной Африке вакцины PCV13.

Методы: Мы проанализировали зарегистрированные в рамках национального лабораторного эпиднадзора случаи ИПИ за 2005–2020 годы и сравнили заболеваемость устойчивой ИПИ до и после внедрения PCV. Чувствительность к шести антибиотикам определяли с помощью тестирования. Множественную устойчивость к пенициллину определяли как нечувствительность к пенициллину в сочетании с устойчивостью как минимум к двум дополнительным классам антибиотиков. Для определения серотипов, последовательностных типов, глобальных кластеров пневмококковых последовательностей (GPSC) и детерминант устойчивости к противомикробным препаратам использовали полногеномное секвенирование.

Результаты: После внедрения PCV заболеваемость ИПИ в целом и ИПИ с устойчивостью к противомикробным препаратам значительно снизилась. У детей младше 5 лет заболеваемость ИПИ, вызванной пневмококками, нечувствительными к пенициллину и ко-тримоксазолу, снизилась с 5,6 до 0,8 на 100 000 населения (относительное изменение −86,5%; ДИ от −90,5 до −81,4%), а заболеваемость ИПИ с множественной устойчивостью к пенициллину — с 5,5 до 0,4 на 100 000 (−93,0%; ДИ от −95,7 до −89,1%). У лиц в возрасте 5 лет и старше снижение было менее выраженным, но также статистически значимым. Несмотря на это, после внедрения PCV13 заметный вклад в заболеваемость ИПИ, вызванной пневмококками, нечувствительными к пенициллину и ко-тримоксазолу, и ИПИ с множественной устойчивостью к пенициллину по-прежнему вносили остаточные серотипы, входящие в состав PCV13, — прежде всего 19A и 19F соответственно. В период после внедрения PCV13 невакцинные серотипы (10A, 15A, 15B/C, 16F, 23B и 35B) всё чаще становились причиной устойчивой ИПИ вследствие расширения линий GPSC как вакцинных, так и невакцинных серотипов.

Выводы: В Южной Африке PCV значительно снизили заболеваемость ИПИ с устойчивостью к противомикробным препаратам. Сохранение серотипов, входящих в состав PCV13, и распространение устойчивых линий невакцинных серотипов указывают на потенциальную пользу вакцин с более широким серотипным составом, включая PCV20.