Расчёт структур и свободных энергий сложных молекул: сочетание молекулярной механики и континуальных моделей
Calculating structures and free energies of complex molecules: combining molecular mechanics and continuum models
Аннотация
Представлен исторический обзор применения молекулярной динамики (МД) к биологическим макромолекулам. Благодаря последним разработкам, сочетающим современные силовые поля с расчётами сольватации в континуальной модели, стало возможным перейти к четвёртому этапу применения МД: по её траекториям во многих случаях удаётся получать как точные структуры, так и точные относительные свободные энергии. Примеры такого применения приведены для дуплексов нуклеиновых кислот, шпилек РНК, траекторий сворачивания белков, а также взаимодействий белок—лиганд, белок—белок и белок—нуклеиновая кислота.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.