Индекс насыщения заменами и его применение
An index of substitution saturation and its application
Аннотация
Предложен новый индекс для измерения насыщения заменами в наборе выровненных нуклеотидных последовательностей. Индекс основан на понятии энтропии в теории информации. Критические значения индекса определены с помощью компьютерного моделирования для последовательностей разной длины, различного числа операционных таксономических единиц и разных топологий. Критическое значение позволяет быстро оценить, пригоден ли набор выровненных последовательностей для филогенетического анализа. Работу индекса продемонстрировали на примере анализа выровненных последовательностей гена фактора элонгации 1α, первоначально использованных для реконструкции глубокой филогении основных групп членистоногих. Метод реализован в программе DAMBE.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.