Медицинская химия и молекулярная операционная среда (MOE): применение QSAR-моделирования и молекулярного докинга в разработке лекарственных препаратов

Поиск новых соединений с заданной биологической активностью требует огромных трудовых и финансовых затрат. Это связано с необходимостью синтезировать большое число соединений и затем оценивать их биологическую активность. Поэтому фармацевтическая промышленность проявляет большой интерес к теоретическим методам, позволяющим осуществлять рациональное проектирование лекарственных препаратов. В последние годы биоинформатика получила значительное развитие благодаря созданию специализированного программного обеспечения и росту вычислительных мощностей. Представление структурной информации о молекулах с помощью молекулярных дескрипторов и последующий анализ данных позволяют строить модели количественной зависимости «структура—активность» (QSAR), которые можно применять для проектирования новых лекарственных препаратов и их виртуального скрининга. Развитие современных методов молекулярного докинга также позволяет точнее прогнозировать биологическую активность соединений. Кроме того, с помощью таких вычислительных методов и теоретических подходов можно выдвигать гипотезы о механизме действия лекарственных препаратов. В настоящей работе кратко описан ряд исследований, выполненных с использованием программной среды MOE (Molecular Operating Environment), с особым вниманием к аспектам медицинской химии.