Сравнительная геномика: бактериальный пангеном

Секвенирование бактериальных геномов стало настолько простым и доступным, что уже получены и будут получать геномы множества штаммов всё большего числа видов. Эти наборы данных позволяют подробно изучать внутривидовое разнообразие с разных сторон. Всё шире применяют анализ пангенома, который позволяет оценить размер генного репертуара вида и число полногеномных последовательностей, необходимых для полноценного анализа. Существуют разные модели такого анализа; их точность и применимость зависят от конкретной задачи. В статье рассматриваются современные модели и предлагается новая модель широкого применения, возможности которой демонстрируются на примерах.