Комплексная база данных по устойчивости к антибиотикам

Разработка новых антибиотиков и мониторинг новых генетических элементов устойчивости к антибиотикам пока не в полной мере используют возможности геномной революции. Несмотря на то что первые геномы свободноживущих организмов принадлежали бактериям, было создано мало специализированных биоинформатических инструментов для анализа постоянно увеличивающегося объёма геномных данных о патогенах. В частности, существует немного инструментов для изучения генетики и геномики устойчивости к антибиотикам, а также её влияния на бактериальные популяции, экосистемы и клиническую практику. Мы начали разработку таких инструментов в рамках Комплексной базы данных по устойчивости к антибиотикам (CARD; http://arpcard.mcmaster.ca). CARD объединяет разнородные молекулярные данные и данные о последовательностях, использует уникальный принцип систематизации — онтологию устойчивости к антибиотикам (ARO), — и позволяет быстро выявлять предполагаемые гены устойчивости к антибиотикам в новых неаннотированных геномных последовательностях. Эта уникальная платформа представляет собой информационный инструмент, связывающий проблемы устойчивости к антибиотикам в здравоохранении, сельском хозяйстве и окружающей среде.