Анатомическая характеристика Cre-драйверных линий мышей для картирования и манипуляции нейронными цепями

Для существенного прогресса в анализе мозга на уровне нейронных цепей необходимы инструменты, позволяющие маркировать клетки, регулировать экспрессию генов, вести мониторинг клеточной активности и управлять ею в определённых типах клеток и/или анатомических областях. Крупные проекты и отдельные лаборатории создали сотни линий мышей, в которых экспрессия Cre-рекомбиназы направляется промоторами специфичных генов. Эти линии незаменимы для генетического доступа к субпопуляциям клеток мозга. Однако потенциал каждой линии может быть реализован не полностью без систематической характеристики распределения экспрессии трансгена во всём мозге. Мы создали высокопроизводительный комплекс методов гибридизации in situ, визуализации и обработки данных для описания экспрессии генов во всём мозге мышей с Cre-драйверными линиями. В настоящее время анатомические данные более чем по 100 таким линиям находятся в открытом доступе в базе данных Института Аллена по характеристике трансгенных линий. Эти данные помогут исследователям выбирать подходящие Cre-драйверы для функциональных, молекулярных исследований и изучения связей между различными областями мозга и/или типами клеток.