Молекулярный докинг и стратегии структурно-ориентированного дизайна лекарственных препаратов

Фармацевтические исследования успешно включили в различные программы поиска лекарственных средств широкий спектр методов молекулярного моделирования для изучения сложных биологических и химических систем. Сочетание вычислительных и экспериментальных подходов оказалось весьма ценным для идентификации и разработки новых перспективных соединений. Молекулярный докинг, широко применяемый в современном дизайне лекарственных препаратов, позволяет изучать конформации лигандов, принимаемые ими в центрах связывания макромолекулярных мишеней. Этот подход также позволяет оценивать свободную энергию связывания лиганда с рецептором путем анализа ключевых явлений, участвующих в процессе межмолекулярного распознавания. В настоящее время доступен ряд алгоритмов докинга, поэтому понимание преимуществ и ограничений каждого метода имеет принципиальное значение для разработки эффективных стратегий и получения достоверных результатов. Цель настоящего обзора — рассмотреть современные стратегии молекулярного докинга, используемые в поиске лекарственных средств и медицинской химии, и оценить достижения в этой области, а также роль интеграции структурно-ориентированных и лиганд-ориентированных методов.