Анализ метилирования ДНК: как выбрать подходящий метод

В активно развивающейся области эпигенетики доступно несколько методов определения статуса метилирования образцов ДНК. Однако выбор метода, наиболее подходящего для ответа на конкретный биологический вопрос, по-прежнему остаётся сложной задачей. Цель этого обзора — предложить биологам, особенно начинающим работать в области эпигенетики, простой алгоритм выбора наиболее подходящего анализа с учётом задач исследования. Прежде всего все методы разделены на две категории: используемые для (1) выявления неизвестных эпигенетических изменений и (2) оценки метилирования ДНК в представляющих интерес определённых регуляторных участках или генах. Затем методы рассмотрены и ранжированы по надёжности, возможностям высокопроизводительного анализа и стоимости. Обзор охватывает большинство доступных на сегодняшний день методов, однако особое внимание уделено коммерчески доступным наборам и другим простым и удобным решениям, доказавшим свою практическую ценность.