Выявление новых пептидов, связывающих TNF-α, с помощью фагового дисплея и компьютерное моделирование способов их связывания

Целью исследования было выявление новых пептидов, блокирующих TNF-α, с использованием технологии фагового дисплея. Были идентифицированы два новых 7-аминокислотных пептида, связывающих TNF-α, — P51 и P52, со значениями Kd 1,47 и 0,51 нМ соответственно. Фаговые частицы, экспонирующие пептиды P51 и P52, при концентрации 0,318 нМ снижали цитотоксическое действие TNF-α на клетки L929 на 8,2 и 16,15% соответственно. Синтезированные пептиды P51 и P52 также подавляли TNF-α-индуцированную цитотоксичность; значения IC50 составили 25,15 ± 2,18 и 7,08 ± 2,24 мкМ соответственно. Результаты ОТ-ПЦР также подтверждают ингибирующую активность выявленных пептидов: P51 и P52 значительно подавляли индуцированное TNF-α повышение уровня мРНК IκB-α. Ингибирующее действие пептидов связывают с их способностью связываться в области межсубъединичных интерфейсов, вызывая диссоциацию TNF-α. Согласно результатам молекулярного докинга, комплексы пептидов с TNF-α преимущественно стабилизируются гидрофобными контактами.