Современные и перспективные применения капельной цифровой ПЦР в онкологии

В последние годы подходы к лечению рака стали более персонализированными. Для этого необходимо всесторонне понимать сложные молекулярные особенности роста и эволюции опухоли, а также механизмы лекарственной устойчивости, приводящие к прогрессированию заболевания. Благодаря высокой чувствительности и специфичности капельная цифровая ПЦР (ddPCR) стала одним из наиболее точных и надёжных методов выявления генетических изменений при различных злокачественных новообразованиях. В настоящее время ddPCR применяют для абсолютного количественного определения аллелей, выявления редких мутаций, анализа вариаций числа копий, метилирования ДНК и перестроек генов в различных клинических образцах. Метод оказался полезен при исследовании архивных образцов опухолевой ткани, когда низкое качество ДНК и ограниченный объём материала затрудняют применение стандартных методов: ddPCR обеспечивает менее субъективные и более автоматизированные количественные результаты. Однако большинство онкологических применений ddPCR связано с жидкостной биопсией, включая анализ внеклеточной ДНК и циркулирующих опухолевых клеток. Такие образцы служат неинвазивной альтернативой биопсии ткани, позволяют точнее учитывать внутриопухолевую гетерогенность и отслеживать изменения опухолевой нагрузки в ответ на лечение в ходе наблюдения. В крови с помощью ddPCR исследуют широкий спектр молекулярных маркеров для диагностики, прогнозирования ответа и мониторинга различных злокачественных новообразований. Также разрабатываются альтернативные подходы с использованием других биологических жидкостей, например спинномозговой жидкости и мочи. Цель этой статьи — дать всесторонний обзор применения ddPCR для молекулярного скрининга в онкологии.