Частота ложноотрицательных результатов ПЦР-тестирования на COVID-19: анализ при несовпадающих результатах исследований

Введение: COVID-19 диагностируют путем выявления РНК SARS-CoV-2 методом полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в реальном времени (ОТ-ПЦР в реальном времени). Характеристики многих ОТ-ПЦР-анализов на SARS-CoV-2 изучены не до конца из-за отсутствия эталонного стандарта. Мы оценили частоту ложноотрицательных результатов (ЧЛО) и чувствительность разработанного в лаборатории ОТ-ПЦР-теста на SARS-CoV-2, нацеленного на гены оболочки (E) и РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp).

Методы: Были проанализированы результаты ОТ-ПЦР на SARS-CoV-2 в Общественной лаборатории здравоохранения Альберты (Канада) с 21 января по 18 апреля 2020 года для выявления пациентов, у которых первоначальный отрицательный результат ОТ-ПЦР сменялся положительным при повторном тестировании в течение 14 дней (несовпадающие результаты). Отрицательные образцы из этих несовпадающих случаев повторно исследовали с использованием трех альтернативных тестов ОТ-ПЦР (нацеленных на ген E и регионы N1/N2 генов нуклеокапсида), чтобы оценить наличие ложноотрицательных результатов.

Результаты: За указанный период на SARS-CoV-2 протестировали 95 919 пациентов (100 001 образец). У 49 пациентов выявили несовпадающие результаты, включая 49 положительных и 52 отрицательных мазка. Повторное исследование 52 отрицательных мазков выявило пять ложноотрицательных результатов (у пяти разных пациентов). При допущении 100% специфичности диагностического теста частота ложноотрицательных результатов и чувствительность в этой группе пациентов с несовпадающими результатами составили 9,3% (95% ДИ 1,5–17,0%) и 90,7% (95% ДИ 82,6–98,9%) соответственно.

Выводы: Исследования, позволяющие понять частоту ложноотрицательных результатов рутинно используемых тестов, важны для подтверждения их надлежащей клинической эффективности. В этом исследовании большинство ложноотрицательных результатов было обусловлено низкой концентрацией вируса SARS-CoV-2 у пациентов при заборе нескольких образцов на разных стадиях инфекции. Рекомендуется клиническая оценка каждого пациента после тестирования, чтобы ОТ-ПЦР не была единственным основанием для исключения COVID-19.