Рекомендации по применению и интерпретации методов мониторинга аутофагии (4-е издание)¹

В 2008 году мы опубликовали первые рекомендации по стандартизации исследований аутофагии. С тех пор эта тема привлекает всё больше внимания, и к данной области присоединилось множество исследователей. Расширились также наши знания и набор доступных технологий. Поэтому необходимо регулярно обновлять рекомендации по мониторингу аутофагии у разных организмов. Несмотря на многочисленные обзоры, сохраняется путаница в отношении приемлемых методов оценки аутофагии, особенно у многоклеточных эукариот. В настоящей работе представлены рекомендации, призванные помочь исследователям выбирать и интерпретировать методы изучения аутофагии и связанных с ней процессов, а рецензентам — давать реалистичную и обоснованную оценку публикациям, посвящённым этим процессам. Эти рекомендации не следует воспринимать как догматический свод правил, поскольку пригодность любого метода в значительной степени зависит от поставленного вопроса и используемой системы. Кроме того, ни один метод не является идеальным в любой ситуации, поэтому для надёжного мониторинга аутофагии в каждом конкретном эксперименте необходимо применять несколько методик. Наконец, было показано, что ряд ключевых компонентов аутофагического аппарата участвует в различных аутофагических процессах — канонической и неканонической аутофагии. Это означает, что при генетической блокаде аутофагии целесообразно воздействовать как минимум на два гена, связанных с аутофагией и участвующих, по возможности, в разных этапах этого пути. Аналогичным образом, поскольку многие белки, участвующие в аутофагии, регулируют и другие клеточные пути, включая апоптоз, не все они могут служить специфическими маркерами аутофагических реакций. В настоящей работе критически рассматриваются современные методы оценки аутофагии, а также сведения, которые они позволяют получить или не позволяют получить. Наша конечная цель — содействовать подлинным интеллектуальным и техническим инновациям в этой области.