Martini 3: универсальное силовое поле для крупнозернистой молекулярной динамики
Martini 3: a general purpose force field for coarse-grained molecular dynamics
Аннотация
Крупнозернистое силовое поле Martini широко применяют для моделирования биомолекул. В настоящей работе представлена усовершенствованная модель Martini 3 (http://cgmartini.nl) с улучшенным балансом взаимодействий, новыми типами частиц и расширенными возможностями учёта специфических взаимодействий, включая, например, водородные связи и электронную поляризуемость. Обновлённая модель позволяет в целом точнее предсказывать молекулярную упаковку и взаимодействия, что продемонстрировано на разнообразных примерах: от данных о распределении между маслом и водой и смешиваемости до сложных молекулярных систем с белок-белковыми и белок-липидными взаимодействиями, а также приложений в материаловедении, включая ионные жидкости и аэдамеры.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.