Варианты SARS-CoV-2, мутации спайкового белка и ускользание от иммунного ответа

Хотя большинство мутаций в геноме коронавируса 2, вызывающего тяжёлый острый респираторный синдром (SARS-CoV-2), вероятно, оказываются либо вредными и быстро устраняются отбором, либо относительно нейтральными, небольшая их часть влияет на функциональные свойства вируса и может изменять его инфекционность, тяжесть заболевания или взаимодействие с иммунной системой хозяина. После появления SARS-CoV-2 в конце 2019 года наблюдался период относительного эволюционного стазиса продолжительностью около 11 месяцев. Однако с конца 2020 года эволюция SARS-CoV-2 характеризуется появлением наборов мутаций в рамках «вариантов, вызывающих обеспокоенность», которые влияют на свойства вируса, включая его передаваемость и антигенность, вероятно, в ответ на изменения иммунного профиля человеческой популяции. Появляются данные о снижении нейтрализации некоторых вариантов SARS-CoV-2 сывороткой после вакцинации, однако для оценки возможного влияния этого явления на эффективность вакцин необходимо лучше понимать корреляты защиты. Тем не менее производители готовят платформы для возможного обновления вакцинных последовательностей, а надзор за генетическими и антигенными изменениями в глобальной популяции вируса необходимо проводить одновременно с экспериментами, позволяющими установить фенотипические последствия мутаций. В этом обзоре обобщены данные литературы о мутациях спайкового белка SARS-CoV-2 — основного антигена вируса; основное внимание уделено их влиянию на антигенность с учётом структуры белка, а также сопоставлению этих данных с частотой выявления мутаций в глобальных наборах данных о вирусных последовательностях.