Исследования in silico и in vitro потенциала полифенолов Alchemilla viridiflora Rothm. для ингибирования проникновения SARS-CoV-2 в клетки

С начала пандемии COVID-19 стало очевидно, что вирусные инфекции представляют серьёзную угрозу для здоровья людей во всём мире. Некоторые растения, особенно богатые полифенолами, оказались эффективными противовирусными средствами. Изучали способность метанольного экстракта Alchemilla viridiflora Rothm. (Rosaceae) предотвращать взаимодействие шиповидного (S-) гликопротеина вируса с рецепторами ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2) и нейропилина-1 (NRP1). В исследованиях in vitro изученные образцы ингибировали 50% взаимодействий вируса с рецепторами при концентрациях 0,18 и 0,22 мг/мл для NRP1 и ACE2 соответственно. Молекулярный докинг показал, что соединения класса эллагитаннинов обладают более высокой аффинностью к S-гликопротеину, тогда как флавоноидные соединения в большей степени взаимодействуют с рецептором NRP1. Кверцетин-3-(6″-ферулилглюкозид) и пентагаллоилглюкоза продемонстрировали наибольшую способность препятствовать взаимодействию с выбранными рецепторами; энергии связывания составили −8,035 ккал/моль для S-гликопротеина и −7,685 ккал/моль для NRP1 соответственно. Кроме того, компьютерное моделирование на других штаммах SARS-CoV-2, возникших вследствие мутаций исходного дикого штамма (V483A, N501Y-K417N-E484K, N501Y, N439K, L452R-T478K, K417N, G476S, F456L, E484K), показало сохранение активности, связанной с проникновением вируса в клетки, однако вклад отдельных соединений различался.