ДНК-штрихкодирование — эффективный инструмент идентификации видов: обзор

ДНК-штрихкодирование — мощный таксономический инструмент для идентификации и выявления видов. Этот метод основан на использовании одного или нескольких стандартизированных коротких участков ДНК для идентификации таксонов. С появлением новых методов секвенирования, таких как секвенирование нового поколения (NGS), нанопоровое секвенирование на платформе ONT MinION и секвенирование PacBio, ДНК-штрихкодирование стало более точным, быстрым и надёжным. Быстрая идентификация видов с помощью ДНК-штрихкодов применяется в различных областях, включая криминалистику, контроль цепочки поставок пищевой продукции и изучение заболеваний. Консорциум Barcode of Life (CBOL) создал различные рабочие группы для определения универсального гена-штрихкода, включая COI у многоклеточных животных; rbcL, matK и ITS у растений; ITS у грибов; ген 16S рРНК у бактерий и архей, а также для создания эталонной библиотеки ДНК-штрихкодов. В статье проанализированы различные предложенные ДНК-штрихкоды для разных организмов, их преимущества и ограничения, последние достижения в области ДНК-штрихкодирования, а также методы ускорения создания эталонной библиотеки ДНК-штрихкодов. Сделан вывод, что создание эталонной библиотеки с широким охватом видов станет важнейшим шагом на пути к идентификации видов с помощью ДНК-штрихкодов. Использование современных методов секвенирования и анализа данных позволит создать такую библиотеку за короткий срок.