Длинные некодирующие РНК: определения, функции, проблемы и рекомендации

Гены, кодирующие длинные некодирующие РНК (lncRNA), занимают значительную часть генома сложных организмов. К lncRNA относят РНК, транскрибируемые РНК-полимеразами I, II и III, а также РНК, образующиеся из процессированных интронов. Разнообразие функций lncRNA, многочисленные изоформы и сложные связи с другими генами затрудняют классификацию и аннотацию этих РНК. Большинство lncRNA эволюционируют быстрее, чем последовательности, кодирующие белки, специфичны для определённых типов клеток и регулируют многие аспекты клеточной дифференцировки, развития и других физиологических процессов. Многие lncRNA взаимодействуют с комплексами, модифицирующими хроматин, транскрибируются с энхансеров и служат центрами фазового разделения ядерных конденсатов и доменов. Это свидетельствует о тесной связи экспрессии lncRNA с пространственной регуляцией экспрессии генов в ходе развития. lncRNA также выполняют важные функции в цитоплазме и других клеточных компартментах, участвуя в регуляции трансляции, метаболизма и передачи сигналов. Структура lncRNA часто имеет модульное строение и содержит множество повторов, значение которых для функций этих РНК подтверждается всё большим числом исследований. В этом консенсусном документе рассматриваются определение и номенклатура lncRNA, их консервативность, экспрессия, фенотипические проявления, структура и функции. Также обсуждаются трудности исследований и приводятся рекомендации, направленные на углубление понимания роли lncRNA в развитии, клеточной биологии и заболеваниях.