Дисбиоз кишечника: экологические причины и причинное влияние на заболевания человека

Микробиота кишечника участвует в развитии многих заболеваний человека, однако высокопроизводительный анализ последовательностей не позволяет напрямую определить состав здоровых микробных сообществ. Поэтому понимание механизмов, лежащих в основе изменений состава микробиоты при заболеваниях (дисбиоза кишечника), остаётся одной из центральных задач исследований микробиома. Данные, полученные в области микробного патогенеза, показывают, что экологической причиной дисбиоза кишечника может быть повышение доступности акцепторов электронов дыхательной цепи, происходящих от организма хозяина; эти факторы в значительной степени определяют состав микробного сообщества. Сходные изменения среды организма также вызывают дисбиоз при ряде хронических заболеваний человека, а более глубокое понимание лежащих в их основе механизмов позволяет установить причинную связь между изменениями состава микробиоты кишечника и усилением симптомов. Согласно формирующейся концепции, гомеостаз поддерживается функциями организма хозяина, регулирующими доступность ресурсов, определяющих рост микробов. Определение дисбиоза как ослабления этих функций позволяет сосредоточиться на его первопричине и выявить потенциальные мишени для терапевтического вмешательства.