Кишечный микробиом при эндометриозе: когортное исследование с участием 1000 женщин

Введение: Эндометриоз — одно из наиболее распространённых гинекологических заболеваний, при котором эндометриоподобная ткань располагается за пределами матки. Несмотря на существование различных теорий, его патогенез остаётся неясным. Новые исследования указывают на возможное участие кишечного микробиома в этиологии эндометриоза, однако связь между микроорганизмами, дисбиозом и развитием заболевания изучена недостаточно. В этом исследовании случай—контроль проанализировали кишечный микробиом женщин с эндометриозом и без него, чтобы выявить микроорганизмы, потенциально связанные с заболеванием.

Методы: Проанализировали подвыборку из 1000 женщин Эстонской когорты микробиома: 136 женщин с эндометриозом и 864 женщины контрольной группы. Состав микробиома определяли методом метагеномного секвенирования, а функциональные пути микроорганизмов аннотировали с использованием базы данных Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Для кластеризации микробных профилей населения Эстонии применяли алгоритм Partitioning Around Medoids (PAM). Альфа- и бета-разнообразие, а также различия в представленности таксонов оценивали для видов микроорганизмов и ортологий KEGG (KO) в обеих группах. Для изучения возможных изменений оси «микробиом — метаболизм эстрогенов» при эндометриозе метагеномные прочтения сопоставляли с последовательностями ферментов эстроболома.

Результаты: Анализ разнообразия не выявил значимых различий между женщинами с эндометриозом и без него (альфа-разнообразие: все значения p > 0,05; бета-разнообразие: PERMANOVA, в обоих случаях R < 0,0007, значения p > 0,05). После поправки на множественные сравнения не выявлено различий в представленности отдельных видов или функциональных путей (все значения p с поправкой на FDR > 0,05). Анализ чувствительности с исключением женщин старше 50 лет подтвердил эти результаты. Число прочтений последовательностей ферментов эстроболома также значимо не различалось между группами (все значения p с поправкой на FDR > 0,05).²

Выводы: Полученные данные не дают достаточных оснований считать, что кишечный микробиом непосредственно участвует в патогенезе эндометриоза. Насколько известно авторам, это крупнейшее на сегодняшний день метагеномное исследование эндометриоза.