Частота пропуска экзона не завышается искусственно из-за повышенного сродства антисмысловых олигонуклеотидов с модификацией трицикло-ДНК к целевому экзону DMD

Антисмысловые олигонуклеотиды (АСО) — перспективные препараты для лечения многих заболеваний, включая нервно-мышечные болезни, такие как мышечная дистрофия Дюшенна (DMD). Несколько препаратов на основе АСО уже одобрены Управлением по контролю качества пищевых продуктов и лекарственных средств США (FDA) для лечения DMD, однако во всём мире продолжаются исследования, направленные на повышение их эффективности, в частности за счёт разработки новых систем доставки или альтернативных химических модификаций. В этом контексте в недавнем исследовании оценивали способность различных химически модифицированных АСО индуцировать пропуск экзона на мышиных моделях DMD. Авторы выявили значительное расхождение между уровнями пропуска экзона и восстановления белка, которое главным образом объяснялось высоким сродством модификаций замкнутой нуклеиновой кислоты (LNA) к целевой РНК. Это сродство нарушало амплификацию продукта с сохранённым экзоном и приводило к искусственному завышению амплификации продукта с пропущенным экзоном. Эти результаты побудили нас проверить, может ли аналогичное явление наблюдаться при применении АСО на основе трицикло-ДНК (tcDNA), также обладающих высоким сродством к целевой РНК. Мы провели серию контрольных экспериментов и показали, что при применении АСО на основе tcDNA уровни пропуска экзона не завышаются из-за влияния на продукт с сохранённым экзоном, в отличие от наблюдений для АСО, содержащих LNA.