MIQE 2.0: пересмотр руководства по минимальному набору сведений для публикации количественных экспериментов с полимеразной цепной реакцией в реальном времени

Введение: В 2009 году руководящие принципы Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments (MIQE) установили стандарты для планирования, проведения и представления результатов количественной полимеразной цепной реакции (qPCR) в научных исследованиях. Расширение применения qPCR во множестве новых областей привело к появлению новых реагентов, методов, расходных материалов и приборов, что потребовало пересмотра оптимальной практики с учетом усложнения современных приложений qPCR.

Содержание: Прозрачное, четкое и исчерпывающее описание всех экспериментальных деталей необходимо для обеспечения воспроизводимости и повторяемости результатов qPCR. Пересмотренные руководящие принципы MIQE отражают последние достижения в технологии qPCR и содержат четкие рекомендации по обращению с образцами, проектированию анализа и валидации, а также указания по анализу данных qPCR. Производителям приборов рекомендуется обеспечивать экспорт необработанных данных, чтобы упростить их детальный анализ и повторную оценку со стороны рецензентов и заинтересованных исследователей. В руководстве подчеркивается, что значения цикла количественного определения (Cq) следует преобразовывать в количества целевого продукта с поправкой на эффективность и представлять с интервалами прогноза, а также указывать пределы обнаружения и динамический диапазон для каждой мишени в зависимости от выбранного метода количественного определения. Кроме того, изложены лучшие практики нормализации и контроля качества, а требования к отчетности уточнены и упрощены. Цель состоит в том, чтобы побудить исследователей предоставлять всю необходимую информацию без чрезмерной нагрузки, тем самым способствуя более строгим и воспроизводимым исследованиям qPCR.

Заключение: На основе совместной работы международной группы исследователей представлены обновления, упрощения и новые рекомендации к исходным руководящим принципам MIQE, призванные сохранить их актуальность и применимость в условиях появления новых технологий и изменения областей применения qPCR.