Мультискейловая транскриптомика хронически воспалённого носового эпителия выявляет динамику иммунных и эпителиальных клеток и ремоделирование ткани при формировании носовых полипов

Хронический риносинусит (ХРС) — распространённое хроническое воспалительное заболевание полости носа и околоносовых пазух, которым страдают миллионы людей во всём мире. Его сложный патогенез остаётся недостаточно изученным, однако появляются данные о роли взаимодействий между различными иммунными и эпителиальными клетками в прогрессировании болезни. Мы применили секвенирование РНК на уровне отдельных клеток (scRNA-seq) и пространственную транскриптомику к диссоциированным и интактным тканям человека у пациентов с ХРС с носовыми полипами и без них и сравнили их с контролем. Мы выявили механизмы рекрутирования макрофагов и эозинофилов, дисрегуляцию CD4- и CD8-T-клеток и обогащение тучных клеток. Мы определили ключевые иммунно-эпителиальные взаимодействия, участвующие в ремоделировании ткани, особенно с вовлечением базальных клеток-предшественников и tuft-клеток. В формировании носовых полипов была задействована отдельная траектория базальных клеток. Независимая валидация с помощью пространственной транскриптомики более чем у 100 пациентов с ХРС показала сохранённые признаки ремоделирования ткани. Наше исследование проясняет патофизиологию ХРС, подчёркивая иммунно-эпителиальные взаимодействия как потенциальные терапевтические мишени при хроническом воспалении, а также служит ресурсом для изучения механизмов иммунных заболеваний.++