Кишечная микробиота и дислипидемия при сахарном диабете 2-го типа: пилотное исследование профилей гена 16S рРНК и прогнозируемых функциональных сдвигов

Гиперлипидемия — один из основных модифицируемых факторов глобального сердечно-сосудистого риска. Кишечная микробиота, включающая бактерии, археи, грибы и вирусы, влияет на липидный обмен посредством преобразования желчных кислот, извлечения энергии из пищи и регуляции воспалительных процессов. В этом исследовании изучили кишечную микробиоту 15 взрослых с сахарным диабетом 2-го типа (СД2) и оценили её связь с показателями липидного профиля натощак. Для этого секвенировали ген 16S рРНК (область V3–V4) на платформе Illumina MiSeq и использовали PICRUSt2 для прогнозирования функций микробиоты. В целом альфа-разнообразие было снижено; в составе микробиоты преобладали Firmicutes и Actinobacteria, а относительное количество Bacteroidetes было меньше. На более низких таксономических уровнях наблюдалось увеличение количества Prevotella copri, Collinsella spp., Ruminococcus spp. и отдельных видов Bifidobacterium, а также уменьшение количества таксонов, ассоциированных с короткоцепочечными жирными кислотами (КЦЖК), включая Akkermansia muciniphila, Lactobacillus plantarum, а также представителей родов Bacteroides и Parabacteroides. При поисковом анализе данных внутри когорты выявлены тенденции: более высокие уровни триглицеридов и более низкий уровень холестерина липопротеинов высокой плотности (ХС-ЛПВП) сочетались с увеличением количества Collinsella и таксонов клостридиального ряда и уменьшением количества таксонов, ассоциированных с КЦЖК. Прогнозируемые функции ортологов по Киотской энциклопедии генов и геномов (KEGG) указывали на изменения липидного и углеводного обмена, а также метаболизма вторичных желчных кислот, что соответствует метаболически активной и провоспалительной среде кишечника. В этой когорте взрослых с СД2, сформированной без группы сравнения, микробиота с низким разнообразием, преобладанием Firmicutes и Actinobacteria и уменьшением количества таксонов, ассоциированных с КЦЖК, сочеталась с атерогенным липидным профилем. Это указывает на связь дисбиоза кишечной микробиоты с нарушениями липидного обмена у взрослых с СД2. Полученные данные позволяют предположить, что в качестве вспомогательных подходов к коррекции липидного обмена при СД2 могут применяться вмешательства с учётом состава микробиоты, включая пищевые ферментируемые волокна, направленный подбор пробиотиков и биотерапевтические препараты нового поколения, а также стратегии, воздействующие на обмен желчных кислот. Исследование было пилотным, поисковым и не включало контрольную группу людей без диабета; его результаты следует рассматривать как основание для выдвижения гипотез. Поперечный дизайн, небольшой размер выборки и ограниченное таксономическое разрешение секвенирования 16S рРНК не позволяют делать выводы о причинно-следственных связях. Для подтверждения выявленных ассоциаций, валидации биомаркеров и изучения механизмов, которые могли бы лечь в основу персонализированных вмешательств при диабетической дислипидемии, необходимы более крупные продольные исследования с применением метагеномного секвенирования и метаболомики.